申請書に添付されているファイルの操作履歴を確認することはできますか？

できます。[ワークフロー］＞［データ管理］＞［ファイル操作履歴］の「日別履歴」を過去1ヶ月分と、「ファイル出力」にて過去1年分の履歴をCSV形式で取得できます。