それほど大容量を利用しているつもりはないのにディスク領域の利用容量があがってしまっているのですが、どうしてですか?

利用者機能の「ツール」にある「一括ダウンロード」をご利用頂いた場合、一括ダウンロード用のファイルが別途作成されてしまうため、その分の容量を消費してしまっている可能性があります。
管理者IDで利用者機能にログインし、[ツール]>[一括ダウンロード]にて利用状況が確認できます。